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求python写的随机森林的roc代码
随机森林在R packages和Python scikit-learn中的实现是当下非常流行的,下列是在R和Python中载入随机森林模型的具体代码:
Python
#Import Library
fromsklearn.ensemble import RandomForestClassifier #use RandomForestRegressor for regression problem
#Assumed you have, X (predictor) and Y (target) for training data set and x_test(predictor) of test_dataset
# Create Random Forest object
model= RandomForestClassifier(n_estimators=1000)
# Train the model using the training sets and check score
model.fit(X, y)
#Predict Output
predicted= model.predict(x_test)
R Code
library(randomForest)
x- cbind(x_train,y_train)
# Fitting model
fit- randomForest(Species ~ ., x,ntree=500)
summary(fit)
#Predict Output
predicted= predict(fit,x_test)
Python 如何画类似辐射图
Python有一些自带的图形例子,在Python目录的Lib\turtledemo下面,通过下面的命令可以执行,forest和tree有点类似你想要的图形,可以参考一下。
pythonw -m turtledemo forest
如何用python实现随机森林分类
大家如何使用scikit-learn包中的类方法来进行随机森林算法的预测。其中讲的比较好的是各个参数的具体用途。
这里我给出我的理解和部分翻译:
参数说明:
最主要的两个参数是n_estimators和max_features。
n_estimators:表示森林里树的个数。理论上是越大越好。但是伴随着就是计算时间的增长。但是并不是取得越大就会越好,预测效果最好的将会出现在合理的树个数。
max_features:随机选择特征集合的子集合,并用来分割节点。子集合的个数越少,方差就会减少的越快,但同时偏差就会增加的越快。根据较好的实践经验。如果是回归问题则:
max_features=n_features,如果是分类问题则max_features=sqrt(n_features)。
如果想获取较好的结果,必须将max_depth=None,同时min_sample_split=1。
同时还要记得进行cross_validated(交叉验证),除此之外记得在random forest中,bootstrap=True。但在extra-trees中,bootstrap=False。
这里也给出一篇老外写的文章:调整你的随机森林模型参数
这里我使用了scikit-learn自带的iris数据来进行随机森林的预测:
[python] view plain copy
from sklearn.tree import DecisionTreeRegressor
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris
iris=load_iris()
#print iris#iris的4个属性是:萼片宽度 萼片长度 花瓣宽度 花瓣长度 标签是花的种类:setosa versicolour virginica
print iris['target'].shape
rf=RandomForestRegressor()#这里使用了默认的参数设置
rf.fit(iris.data[:150],iris.target[:150])#进行模型的训练
#
#随机挑选两个预测不相同的样本
instance=iris.data[[100,109]]
print instance
print 'instance 0 prediction;',rf.predict(instance[0])
print 'instance 1 prediction;',rf.predict(instance[1])
print iris.target[100],iris.target[109]
返回的结果如下:
(150,)
[[ 6.3 3.3 6. 2.5]
[ 7.2 3.6 6.1 2.5]]
instance 0 prediction; [ 2.]
instance 1 prediction; [ 2.]
2 2
在这里我有点困惑,就是在scikit-learn算法包中随机森林实际上就是一颗颗决策树组成的。但是之前我写的决策树博客中是可以将决策树给显示出来。但是随机森林却做了黑盒处理。我们不知道内部的决策树结构,甚至连父节点的选择特征都不知道是谁。所以我给出下面的代码(这代码不是我的原创),可以显示的显示出所有的特征的贡献。所以对于贡献不大的,甚至是负贡献的我们可以考虑删除这一列的特征值,避免做无用的分类。
[python] view plain copy
from sklearn.cross_validation import cross_val_score, ShuffleSplit
X = iris["data"]
Y = iris["target"]
names = iris["feature_names"]
rf = RandomForestRegressor()
scores = []
for i in range(X.shape[1]):
score = cross_val_score(rf, X[:, i:i+1], Y, scoring="r2",
cv=ShuffleSplit(len(X), 3, .3))
scores.append((round(np.mean(score), 3), names[i]))
print sorted(scores, reverse=True)
显示的结果如下:
[(0.934, 'petal width (cm)'), (0.929, 'petal length (cm)'), (0.597, 'sepal length (cm)'), (0.276, 'sepal width (cm)')]
这里我们会发现petal width、petal length这两个特征将起到绝对的贡献,之后是sepal length,影响最小的是sepal width。这段代码将会提示我们各个特征的贡献,可以让我们知道部分内部的结构。