一、ggcorrplot包
ggcorrplot是一个用于绘制相关矩阵热图的R语言包。它是基于ggplot2包的,因此可以轻松地进行样式和主题的自定义。ggcorrplot包的安装方法如下:
# 安装ggcorrplot
install.packages("ggcorrplot")
# 加载数据包
library(ggcorrplot)
二、ggcorrplot如何添加星号
星号表示统计学上的显著性,如果您希望在图形中显示,请按照以下步骤进行:
# 设置显著性阈值为0.05
p.mat = cor_pmat(data, method = "pearson", sig.level = 0.05)
# 将星号添加到相关矩阵的右上角
ggcorrplot(corr = data,
p.mat = p.mat,
hc.order = TRUE,
type="lower",
outline.col = "white",
ggtheme = ggplot2::theme_gray)
三、ggcorrplot参数
ggcorrplot有多个参数可以调整,这里列出了一些常用参数:
type:
热图的类型,可以是"upper"、"lower"或"full"。lab:
标签的位置,可以是"inside"或"outside"。lab_size:
标签大小。palette:
颜色使用哪一个调色板。title:
图形的标题。cor.method:
相关系数计算使用哪一种方法。
# 使用不同的参数调整ggcorrplot
ggcorrplot(corr = data,
type = "lower",
lab = "inside",
lab_size = 3,
palette = "RdYlBu",
title = "Correlation Matrix",
cor.method = "pearson",
ggtheme = ggplot2::theme_gray)
四、ggcorrplot图例刻度
在ggcorrplot中,可以使用scale_fill_gradient()和scale_color_gradient()函数来自定义图例的刻度和标签。
ggcorrplot(corr = data,
type = "lower",
lab = "inside",
lab_size = 3,
palette = "RdYlBu",
title = "Correlation Matrix",
cor.method = "pearson",
ggtheme = ggplot2::theme_gray) +
scale_fill_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation") +
scale_color_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation")
五、ggcorrplot相关性分析
通过检查ggcorrplot将相关性矩阵中的相关关系可视化,可以帮助您更好地了解数据,并更好地发现数据中的模式。下面是一个使用ggcorrplot进行相关性分析的示例:
library(PerformanceAnalytics)
data(managers)
# 计算相关系数矩阵
data = as.data.frame(managers)
corr = cor(data)
# 使用ggcorrplot可视化相关性矩阵
ggcorrplot(corr = corr,
hc.order = TRUE,
type="lower",
outline.col = "white",
ggtheme = ggplot2::theme_gray) +
theme(legend.position = "bottom")
六、ggcorrplot添加显著性
为了在图形中添加显著性,需要使用cor_pmat()函数计算一组比较数据的显著性,并将其作为参数传递给ggcorrplot()函数。
# 计算显著性
p.mat = cor_pmat(data, method = "pearson", sig.level = 0.05)
# 使用ggcorrplot添加显著性
ggcorrplot(corr = data,
p.mat = p.mat,
hc.order = TRUE,
type="lower",
outline.col = "white",
ggtheme = ggplot2::theme_gray)
七、ggcorrplot 添加颜色框
您可以通过添加ggtitle()和ggbackground()函数来控制ggcorrplot的标题和背景颜色。下面是一个使用ggtitle()和ggbackground()函数的示例:
# 添加颜色框和标题
ggcorrplot(corr = corr,
type = "lower",
lab = "inside",
lab_size = 3,
palette = "RdYlBu",
title = "Correlation Matrix",
cor.method = "pearson",
ggtheme = ggplot2::theme_gray) +
scale_fill_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation") +
scale_color_gradient(low = "white", high = "red", limits = c(-1,1), name = "Correlation") +
ggtitle("My Title") +
ggbackground("white")
八、ggcorrplot哪个r版本能用
目前,ggcorrplot可以在R版本3.1.0及更高版本上使用。
九、ggcorrplot绘制相关性热图的R语言选取
ggcorrplot是一个非常流行的R语言包,用于绘制相关性热图。如果您正在处理相关性数据,请尝试使用ggcorrplot进行可视化分析。