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如何用Python打开mat文件

如果你是一个科研人员,你会经常接触.mat后缀名的数据文件。这种类型的文件是MATLAB的默认数据文件类型。如果你需要处理MATLAB生成的数据文件,你需要用Python打开.mat文件。本文将教你如何使用Python打开.mat文件,并在其中查找数据。

一、MATLAB数据文件(.mat)简介

首先我们需要了解.mat文件,这是MATLAB数据文件的默认格式,用于存储各种类型的数据:数值、字符串、字符向量、逻辑值、结构、函数类型、cell数组等等。这种文件格式在MATLAB中被广泛使用,也被许多其他编程语言所支持。

在Python中,我们使用SciPy库处理.mat文件。SciPy库是一种基于NumPy、Matplotlib等库的Python科学计算库。它提供了许多用于科学计算的常用函数和子模块。例如,它提供了用于输入/输出(MATLAB, ASCII等)、线性代数、插值、优化、信号处理、特殊函数、图像处理等常见科学计算问题的函数。

二、使用SciPy库读取.mat文件

1. 安装SciPy库

在使用SciPy库之前,需要先安装它。在命令行中输入以下命令即可:

pip install scipy

如果你的pip安装不成功,你可以到SciPy官网中寻找Windows、Linux或macOS下的安装指南。

2. 解码.mat文件

在SciPy库中,我们使用scipy.io.loadmat()函数加载.mat文件。它返回一个Python字典,其中包含.mat文件中的所有信息。在字典中,键是MATLAB的变量名称,值是MATLAB变量中存储的数值、字符等等。

下面的例子演示了如何解码.mat文件。

import scipy.io as sio
 
mat_file = sio.loadmat('matlab_data.mat')
print(mat_file)

在运行上面的代码后,你将会看到如下结果:

{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: PCWIN64, Created on: Thu Jan 23 10:17:13 2020', 
 'x': array([[1, 2, 3],
             [4, 5, 6]]), 
 '__globals__': [], 
 '__version__': '1.0', 
 'y': array([[7],
             [8],
             [9]])}

这里我们读取了一个名为'matlab_data.mat'的.mat文件,并存储到一个Python变量中,然后打印出它的内容(字典形式)。

字典中包含5个键值对:

  • '__header__': 该键值对包含了MATLAB数据文件的版本、机器类型和创建时间等信息。
  • 'x': 该键值对包含一个矩阵,名为x。
  • '__globals__': 该键值对描述了.mat文件中所有全局变量的名称。
  • '__version__': 该键值对描述MATLAB数据文件的格式版本。
  • 'y': 该键值对包含一个矩阵,名为y。

3. 访问.mat文件中的数据

在访问各个键值对中的值之前,我们需要了解这些值的类型。在上述.mat文件的例子中,我们可以看到两个变量x和y:

x = [[1, 2, 3],
     [4, 5, 6]]
 
y = [[7],
     [8],
     [9]]

在Python中,我们可以使用矩阵或数组来表示这些变量。在SciPy库中,MATLAB的结构体可以表示为Python中的嵌套结构体。

在下面的例子中,我们将演示如何使用Python访问这些变量:

import scipy.io as sio
     
mat_file = sio.loadmat('matlab_data.mat')
 
x = mat_file['x']
y = mat_file['y']
 
print('x =', x)
print('y =', y)

在运行上述代码时,我们得到以下结果:

x = [[1 2 3]
     [4 5 6]]
 
y = [[7]
     [8]
     [9]]

这里的'x'和'y'与我们在MATLAB中打印输出时看到的相似(除了Python使用的方括号,而不是MATLAB中使用的圆括号)。

三、小结

在本文中,我们介绍了如何使用Python读取MATLAB生成的数据文件(.mat文件)。我们使用需要安装的SciPy库中的函数scipy.io.loadmat()解码MATLAB数据文件,并使用Python中的矩阵或数组来表示变量。使用本文中介绍的知识,你将能够使用Python分析.mat文件,并在其中查找数据。