一、共定位分析是什么
共定位分析，也称共定位显微镜，是一种利用两个或多个荧光探针同时标记不同分子，在同一细胞或组织中对它们的相对位置进行研究的方法。共定位分析既可以用来观察分子之间的相互作用，也可以用来定量评估分子复合体的组装状态。
二、共定位分析的方法
共定位分析的基本方法是将两种或多种标记不同颜色的探针同时标记在同一分子上，然后使用共聚焦激光共振显微镜或荧光显微镜等设备进行成像。通过观察荧光信号的分布情况，可以确定这些分子的相对位置。
共定位分析还可以利用聚类算法对荧光信号进行分析，将类似的荧光信号聚集在一起，定量评价分子之间的交互作用强度。
三、共定位分析可视化
共定位分析可以绘制多种图形来帮助研究人员理解和分析荧光信号。其中最常见的是散点图和柱状图。
散点图可以将两个探针的荧光信号在坐标轴上表示出来，通过观察点的分布情况，可以确定它们的相对位置。散点图还可以加入大小和颜色编码，用以表示荧光信号的强度和组装状态。
柱状图则可以将分子之间的交互作用强度表示出来，通过调整柱子的高度和颜色编码，可以定量评价分子之间的交互作用强度。
四、共定位分析结果可以绘制什么图
共定位分析的结果可以绘制多种图形，如散点图、柱状图、热图、3D图等。不同的图形可以帮助研究人员从不同的角度分析荧光信号。
散点图可以用于分析荧光信号的相对位置和组装状态，柱状图则可以用于评价分子之间的交互作用强度。热图则可以显示荧光信号的强度分布情况，3D图则可以将多个探针的荧光信号显示在三维空间中，更直观地表示分子之间的关系。
五、共定位分析软件
以下是ImageJ共定位分析插件的示例代码：
import iconcept.shared.data.DataContainer;
import iconcept.shared.layout.EmbedLayout;
import iconcept.shared.layout.LayoutUtils;
import iconcept.shared.root.BasicContext;
import iconcept.shared.root.BasicLayout;
class Coloc_2 extends EmbedLayout
{
public Coloc_2()
{
super("Colocalization 2");
getPrefs();
// -----------------------------
int[] wList = WindowManager.getIDList();
if (wList==null || wList.length<2) {
return;
}
// Let's find first merged image
ImagePlus imp1 = WindowManager.getImage(wList[0]);
if (imp1.getNChannels()!=2) {
IJ.error("This plugin requires a merged image with\n"
+ "exactly 2 channels.");
return;
}
}
......
}
六、共定位分析名词解释
1. 荧光探针：将荧光分子标记在待研究分子表面，用以观察其在生物学过程中的行为。
2. 共定位分析：一种利用两个或多个荧光探针同时标记不同分子，在同一细胞或组织中对它们的相对位置进行研究的方法。
3. 共聚焦激光共振显微镜：一种高分辨率的荧光成像技术。
4. 聚类算法：一种将数据分成不同类别的统计分析方法。
