一、autodock安装教程
Autodock是一款广泛应用于分子对接研究的软件,适用于Linux、Windows以及Mac OS系统。在进行Autodock的安装前需要先安装好其所需的Autokit和Autocut软件包,保证正常使用。下面我们介绍一下对于不同系统的安装方法。
1.1 Linux系统
首先下载Autodock的安装包,并解压到本地目录中。进入autodock目录,在终端输入以下命令进行编译:
./configure
make
make install
编译完毕后,终端提示Autodock安装成功。如果出现问题,可以查看错误提示进行修复。
1.2 Windows系统
Windows系统需要先下载安装MinGW和MSYS,这两个软件包可以帮助Windows实现Linux下的命令编译功能。安装完成后,下载Autodock的安装包,并解压到本地目录中。进入autodock目录,在MSYS界面中输入以下命令进行编译:
./configure
make
make install
编译完毕后,终端提示Autodock安装成功。如果出现问题,可以查看错误提示进行修复。
1.3 Mac OS系统
Mac OS系统需要先下载安装Xcode和MacPorts,这两个软件包可以帮助Mac OS实现Linux下的命令编译功能。安装完成后,下载Autodock的安装包,并解压到本地目录中。进入autodock目录,在终端输入以下命令进行编译:
export PATH=/opt/local/bin:$PATH
./configure
make
make install
编译完毕后,终端提示Autodock安装成功。如果出现问题,可以查看错误提示进行修复。
二、autokit安装
Autokit是Autodock的依赖软件包,需要在安装Autodock前先进行安装。Autodock中使用的版本为本地安装的MGLtools。
2.1 Linux系统
下载MGLtools的最新版本,并解压到本地指定目录。打开终端,输入以下命令进入MGLtools目录:
cd MGLtools_xxx
进入目录后,输入以下命令进行MGLtools的安装:
python setup.py install
安装完成后,终端提示MGLtools安装成功。可以查看MGLtools的版本号,以确保安装成功。
2.2 Windows系统
下载MGLtools的最新版本,并解压到本地指定目录。在此目录下,双击运行install_win.bat文件进行MGLtools的安装。安装完成后,打开MGLtools并查看版本号,以确保安装成功。
2.3 Mac OS系统
下载MGLtools的最新版本,并解压到本地指定目录。在终端中输入以下命令进入MGLtools目录:
cd MGLtools_xxx
进入目录后,输入以下命令进行MGLtools的安装:
python2.7 setup.py install
安装完成后,终端提示MGLtools安装成功。可以查看MGLtools的版本号,以确保安装成功。
三、autocut安装驱动软件
Autocut需要使用到PDBQT格式的分子结构文件,而这类文件需要在安装Autodock前先进行安装。PDBQT格式的文件需要与特定的驱动软件相匹配,需要提前进行安装。
3.1 Linux系统
安装Linux系统的驱动软件可以参考以下链接:
3.2 Windows系统
安装Windows系统的驱动软件可以参考以下链接:
3.3 Mac OS系统
安装Mac OS系统的驱动软件可以参考以下链接: