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包含处理缺失值的python代码的词条

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缺失值处理

 缺失数据 

1 缺失值的统计和删除 

1.1 缺失信息的统计

缺失数据可以使用 isna 或 isnull (两个函数没有区别)来查看每个单元格是否缺失,通过和 sum 的组合可以计算出每列缺失值的比例。

如果想要查看某一列缺失或者非缺失的行,可以利用 Series 上的 isna 或者 notna 进行布尔索引。例如,查看身高缺失的行:

如果想要同时对几个列,检索出全部为缺失或者至少有一个缺失或者没有缺失的行,可以使用 isna, notna 和any, all 的组合。例如,对身高、体重和转系情况这 3 列分别进行这三种情况的检索

1.2 缺失信息的删除

数据处理中经常需要根据缺失值的大小、比例或其他特征来进行行样本或列特征的删除,pandas 中提供了dropna 函数来进行操作。

dropna 的主要参数为轴方向 axis (默认为 0,即删除行)、删除方式 how 、删除的非缺失值个数阈值 thresh(非缺失值没有达到这个数量的相应维度会被删除)、备选的删除子集 subset ,其中 how 主要有 any 和 all两种参数可以选择。

2 缺失值的填充和插值 

2.1 利用 fillna 进行填充 

在 fillna 中有三个参数是常用的:value, method, limit 。其中,value 为填充值,可以是标量,也可以是索引到元素的字典映射;method 为填充方法,有用前面的元素填充 ffill 和用后面的元素填充 bfill 两种类型,limit 参数表示连续缺失值的最大填充次数。

2.2 插值函数 

在关于 interpolate 函数的 文档 描述中,列举了许多插值法,包括了大量 Scipy 中的方法。由于很多插值方法涉及到比较复杂的数学知识,因此这里只讨论比较常用且简单的三类情况,即线性插值、最近邻插值和索引插值。

对于 interpolate 而言,除了插值方法(默认为 linear 线性插值)之外,有与 fillna 类似的两个常用参数,一个是控制方向的 limit_direction ,另一个是控制最大连续缺失值插值个数的 limit 。其中,限制插值的方向默认为 forward ,这与 fillna 的 method 中的 ffill 是类似的,若想要后向限制插值或者双向限制插值可以指定为 backward 或 both

关于 polynomial 和 spline 插值的注意事项

在 interpolate 中 如 果 选 用 polynomial 的 插 值 方 法, 它 内 部 调 用 的 是scipy.interpolate.interp1d(*,*,kind=order) , 这 个 函 数 内 部 调 用 的 是 make_interp_spline方法,因此其实是样条插值而不是类似于 numpy 中的 polyfit 多项式拟合插值;而当选用 spline方法时,pandas 调用的是 scipy.interpolate.UnivariateSpline 而不是普通的样条插值。这一部分的文档描述比较混乱,而且这种参数的设计也是不合理的,当使用这两类插值方法时,用户一定要小心谨慎地根据自己的实际需求选取恰当的插值方法。

3 Nullable 类型

3.1 缺失记号及其缺陷

在 python 中的缺失值用 None 表示,该元素除了等于自己本身之外,与其他任何元素不相等:

在 numpy 中利用 np.nan 来表示缺失值,该元素除了不和其他任何元素相等之外,和自身的比较结果也返回False

值得注意的是,虽然在对缺失序列或表格的元素进行比较操作的时候,np.nan 的对应位置会返回 False ,但是在使用 equals 函数进行两张表或两个序列的相同性检验时,会自动跳过两侧表都是缺失值的位置,直接返回 True :

在时间序列的对象中,pandas 利用 pd.NaT 来指代缺失值,它的作用和 np.nan 是一致的

那么为什么要引入 pd.NaT 来表示时间对象中的缺失呢?仍然以 np.nan 的形式存放会有什么问题?在 pandas中可以看到 object 类型的对象,而 object 是一种混杂对象类型,如果出现了多个类型的元素同时存储在 Series中,它的类型就会变成 object

NaT 问题的根源来自于 np.nan 的本身是一种浮点类型,而如果浮点和时间类型混合存储,如果不设计新的内置缺失类型来处理,就会变成含糊不清的 object 类型,这显然是不希望看到的。

同时,由于 np.nan 的浮点性质,如果在一个整数的 Series 中出现缺失,那么其类型会转变为 float64 ;而如果在一个布尔类型的序列中出现缺失,那么其类型就会转为 object 而不是 bool

因此,在进入 1.0.0 版本后,pandas 尝试设计了一种新的缺失类型 pd.NA 以及三种 Nullable 序列类型来应对这些缺陷,它们分别是 Int, boolean 和 string 。

3.2 Nullable 类型的性质

从字面意义上看 Nullable 就是可空的,言下之意就是序列类型不受缺失值的影响。例如,在上述三个 Nullable类型中存储缺失值,都会转为 pandas 内置的 pd.NA

在 Int 的序列中,返回的结果会尽可能地成为 Nullable 的类型

对于 boolean 类型的序列而言,其和 bool 序列的行为主要有两点区别:

第一点是带有缺失的布尔列表无法进行索引器中的选择,而 boolean 会把缺失值看作 False

第二点是在进行逻辑运算时,bool 类型在缺失处返回的永远是 False ,而 boolean 会根据逻辑运算是否能确定唯一结果来返回相应的值。那什么叫能否确定唯一结果呢?举个简单例子:True | pd.NA 中无论缺失值为什么值,必然返回 True ;False | pd.NA 中的结果会根据缺失值取值的不同而变化,此时返回 pd.NA ;False pd.NA 中无论缺失值为什么值,必然返回 False 。

3.3 缺失数据的计算和分组

当调用函数 sum, prob 使用加法和乘法的时候,缺失数据等价于被分别视作 0 和 1,即不改变原来的计算结果

当使用累计函数时,会自动跳过缺失值所处的位置:

当进行单个标量运算的时候,除了 np.nan ** 0 和 1 ** np.nan 这两种情况为确定的值之外,所有运算结果全为缺失(pd.NA 的行为与此一致),并且 np.nan 在比较操作时一定返回 False ,而 pd.NA 返回 pd.NA

另外需要注意的是,diff, pct_change 这两个函数虽然功能相似,但是对于缺失的处理不同,前者凡是参与缺失计算的部分全部设为了缺失值,而后者缺失值位置会被设为 0% 的变化率

对于一些函数而言,缺失可以作为一个类别处理,例如在 groupby, get_dummies 中可以设置相应的参数来进行增加缺失类别:

4 练习 

4.1 Ex1:缺失值与类别的相关性检验

.4.2 Ex2:用回归模型解决分类问题

python中利用pandas怎么处理缺省值

null/None/NaN

null经常出现在数据库中

None是Python中的缺失值,类型是NoneType

NaN也是python中的缺失值,意思是不是一个数字,类型是float

在pandas和Numpy中会将None替换为NaN,而导入数据库中的时候则需要把NaN替换成None

找出空值

isnull()

notnull()

添加空值

numeric容器会把None转换为NaN

In [20]: s = pd.Series([1, 2, 3])

In [21]: s.loc[0] = None

In [22]: s

Out[22]:

0 NaN

1 2.0

2 3.0

dtype: float641234567891012345678910

object容器会储存None

In [23]: s = pd.Series(["a", "b", "c"])

In [24]: s.loc[0] = None

In [25]: s.loc[1] = np.nan

In [26]: s

Out[26]:

0 None

1 NaN

2 c

dtype: object123456789101112123456789101112

空值计算

arithmetic operations(数学计算)

NaN运算的结果是NaN

statistics and computational methods(统计计算)

NaN会被当成空置

GroupBy

在分组中会忽略空值

清洗空值

填充空值

fillna

DataFrame.fillna(value=None, method=None, axis=None, inplace=False, limit=None, downcast=None, **kwargs)

参数

value : scalar, dict, Series, or DataFrame

method : {‘backfill’, ‘bfill’, ‘pad’, ‘ffill’, None}, default None(bfill使用后面的值填充,ffill相反)

axis : {0 or ‘index’, 1 or ‘columns’}

inplace : boolean, default False

limit : int, default None

downcast : dict, default is None

返回值

filled : DataFrame

Interpolation

replace

删除空值行或列

DataFrame.dropna(axis=0, how=’any’, thresh=None, subset=None, inplace=False)

参数

axis : {0 or ‘index’, 1 or ‘columns’}, or tuple/list thereof

how : {‘any’, ‘all’}

thresh : int, default None

subset : array-like

inplace : boolean, default False

返回

dropped : DataFrame

如何使用Python 对缺失值进行处理

录入的时候可以直接省略不录入分析的时候也一般剔除这样的样本。但也有替换的方法,一般有:均值替换法(meanimputation),即用其他个案中该变量观测值的平均数对缺失的数据进行替换,但这种方法会产生有偏估计,所以并不被推崇。个别替换法(singleimputation)通常也被叫做回归替换法(regressionimputation),在该个案的其他变量值都是通过回归估计得到的情况下,这种方法用缺失数据的条件期望值对它进行替换。这虽然是一个无偏估计,但是却倾向于低估标准差和其他未知性质的测量值,而且这一问题会随着缺失信息的增多而变得更加严重。多重替代法(multipleimputation)(Rubin,1977)。?它从相似情况中或根据后来在可观测的数据上得到的缺省数据的分布情况给每个缺省数据赋予一个模拟值。结合这种方法,研究者可以比较容易地,在不舍弃任何数据的情况下对缺失数据的未知性质进行推断(LittleandRubin,1987;ubin,1987,1996)。

python填充缺失值

对于大多数情况而言,fillna方法是最主要的函数。通过一个常数调用fillna就会将缺失值替换为那个常数值。

fillna(value)

参数:value

说明:用于填充缺失值的标量值或字典对象

#通过常数调用fillna

书写方式:df.fillna(0) #用0替换缺失值

#通过字典调用fillna

书写方式:df.fillna({1:0.5,3:-1})

fillna(value,inplace=True)

参数:inplace

说明:修改调用者对象而不产生副本

#总是返回被填充对象的引用

书写方式:df.fillna(0,inplace=True)

fillna(method=ffill)

参数:method

说明:插值方式。如果函数调用时未指定其他参数的话,默认为“ffill”

对reindex有效的那些插值方法也可用于fillna:

In [23]: from numpy import nan as NA

In [21]: df=DataFrame(np.random.randn(6,3))

In [24]: df.ix[2:,1]=NA;df.ix[4:,2]=NA

In [25]: df

Out[25]:

0 1 2

0 -0.863925 1.005127 -0.529901

1 0.701671 -0.501728 -0.617387

2 -0.951060 NaN -0.263626

3 0.810230 NaN -0.277401

4 -0.403899 NaN NaN

5 -0.081091 NaN NaN

In [26]: df.fillna(method='ffill')

Out[26]:

0 1 2

0 -0.863925 1.005127 -0.529901

1 0.701671 -0.501728 -0.617387

2 -0.951060 -0.501728 -0.263626

3 0.810230 -0.501728 -0.277401

4 -0.403899 -0.501728 -0.277401

5 -0.081091 -0.501728 -0.277401

fillna(limit=2)

参数:limit

说明:(对于前向和后向填充)可以连续填充的最大数量

In [27]: df.fillna(method='ffill',limit=2)

Out[27]:

0 1 2

0 -0.863925 1.005127 -0.529901

1 0.701671 -0.501728 -0.617387

2 -0.951060 -0.501728 -0.263626

3 0.810230 -0.501728 -0.277401

4 -0.403899 NaN -0.277401

5 -0.081091 NaN -0.277401

fillna(data.mean())

只要稍微动动脑子,就可以利用fillna实现许多别的功能。比如说,可以传入Series的平均值或中位数:

In [28]: data=Series([1,NA,3.5,NA,7])

In [29]: data.fillna(data.mean())